本发明涉及一种青霉素降解菌株的发酵方法，包括如下步骤：步骤S1：将副球菌KDSPL‑02菌悬液离心，并将离心后的沉淀物接种到发酵培养液中；步骤S2：加入微量元素溶液及青霉素，搅拌发酵；步骤S3：每隔8‑16个小时补料一次，补料2‑5次后发酵结束。本发明提供的青霉素降解菌株的发酵方法，发酵工艺容易控制，使用原料易得，成本低，产品活菌数高，易保存，全细胞能有效降解青霉素，可用于高效降解青霉素发酵菌渣中的青霉素残留，实现其无害化处理，为青霉素发酵菌渣资源化综合利用奠定了基础。