本发明供给了一种双燃料发动机燃烧模式的切换控制方法、系统及车辆，该方法包括：在由第一燃烧模式向第二燃烧模式切换时，控制双燃料发动机的火花塞停止点火；在由第二燃烧模式向第三燃烧模式切换时，以缸内直喷的方式供给预设量的柴油，并相应地减少汽油的供给量；在由第三燃烧模式向第四燃烧模式切换时，逐渐增加柴油的供给量，并逐渐减少汽油的供给量，并将柴油的后喷相位由第一相位逐渐前移至第二相位。本发明的方法不仅能够提高发动机的热效率，还可以提高车辆的平顺性。