本发明涉及一种防治果蔬根腐病的地衣芽孢杆菌Z‑13菌株及其应用，该菌株已于2020年9月25日保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，其保藏编号为CGMCC No.20823；保藏地址为北京市朝阳区北辰西路1号院3号。该地衣芽孢杆菌Z‑13菌株对引起果蔬根腐病的常见病原菌具有显著的拮抗作用，能够有效防治果蔬根腐病。同时，该地衣芽孢杆菌Z‑13菌株还具有较强的产生3‑吲哚乙酸和嗜铁素的能力，能够促进植物对营养物质的吸收，从而促进植物生长。