SSR(Simple  sequencerepeat)即简单序列重复，又称为微卫星DNA(microsatelliteDNA)，在真核生物基因组中，SSR仅由几个核有酸(1‑6个)组成重复单位，如((CT)n，(AC)n，(ACT)n(其中n为重复次数)等，重复次数10‑20，同一类微卫星DNA可分布在整个基因组不同位置上，由于重复次数的不同，或重复程度的不完全，而形成每个座位的多态性。每类微卫星DNA两端的序列多是相对保守的单拷贝序列，可根据两端序列设计一对特异引物，扩增每个位点微卫星序列。

目前，SSR也是发展最快、应用最广的一类标记。SSR标记具有以下特点：①在真核生物基因组中广泛分布，大约每隔10‑15kb就存在一个微卫星标记；②数量多，具有丰富的多态性；③具有多等位基因的特性，信息含量大；④呈共显性遗传，即能区分纯合子和杂合子；⑤等位基因的分离遵循孟德尔规律；⑥实验操作简单、结果稳定可靠；⑦基于PCR技术，可实现自动化检测；⑧具有连锁不平衡现象；⑨重复性较好。因此，微卫星标记技术目前已广泛地应用于生物DNA指纹图谱、种质资源的鉴定、遗传连锁图谱的构建、遗传多样性、等位基因变异和遗传关系及遗传结构等方面。

三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)是一种重要的海洋经济蟹类，北起中国辽东半岛、南至广东沿海，以及日本、朝鲜、马来群岛、红海等海域均有分布。1981年三疣梭子蟹被列为我国海洋水产养殖对象。近年来由于过度捕捞和环境污染造成三疣梭子蟹野生资源减少，养殖过程中各种病害不断发生。目前，沿海地区工业污染导致水质变差，由此使三疣梭子蟹生存环境遭到破坏，优质亲本数量急剧减少，养殖面积大幅度下降。因此，开发针对分析三疣梭子蟹遗传结构的微卫星引物，采用分子遗传标记的手段分析三疣梭子蟹种质资源现状，研究其种群遗传学以及利用分子标记进行育种，这对了解三疣梭子蟹的遗传多样性和种群结构、有效保护三疣梭子蟹野生资源、开发良种以及保育原种，对生物多样性的保护和生物资源的可持续利用具有重要意义。