本实用新型公开了一种基于嵌入式和Web服务的电能质量在线监测系统，包括依次电连接的互感器、信号调理模块、数据采集卡、FPGA机箱、实时控制器、Web服务器、路由器和客户PC，所述互感器包括电压互感器和电流互感器，所述FPGA机箱受所述实时控制器控制，所述FPGA机箱通过PCI总线向所述实时控制器发送电网波形数据，同时接受所述实时控制器的命令。这种在线监测系统能够在本地监测分析电网电能质量数据，远方计算机可以异地直接查看，并且可以向本地电能质量监测装置发送命令，大大节省了客户的资源与精力。