本申请公开了一种自动化控制的低温驯化富集培养装置，包括反应系统、执行系统和控温系统，反应系统包括培养瓶组、原料储藏瓶、废弃物收集瓶，执行系统包括可编程自动化控制的蠕动泵组和管线，蠕动泵组分为进样蠕动泵和出样蠕动泵，控温系统包括恒温磁力搅拌水浴锅和低温储藏柜，恒温磁力搅拌水浴锅上设置有恒温水浴锅。本申请结构合理，通过设定蠕动泵参数可实现培养基和培养物的定时、定量、自动地添加和移出，可以节省人力成本，可以有效的防止培养体系污染杂菌，将反应系统和执行系统放置于低温冷藏柜中，可实现培养基预冷和低温培养驯化，将反应瓶置于恒温磁力水浴锅中，进一步保证温控的准确性。