抗边界约束干扰的时变刚度参数识别方法、存储介质及设备，属于桥梁工程健康监测技术领域。为了解决现有的识别方法不能有效识别桥梁结构的时变刚度参数问题。本发明首先基于桥梁损伤位置检测技术识别桥梁结构的损伤位置并编号。然后根据桥梁结构对应的初始状态量及初始状态量协方差，并基于无迹卡尔曼滤波器算法进行初步识别，计算出每步对应的灵敏参数并绘制时程曲线。根据时程曲线是否有峰值脉冲出现，进行进一步识别，当有峰值脉冲出现，调用抗边界约束干扰的自适应无迹卡尔曼滤波器算法进行识别，在此识别过程中针对结构状态量协方差进行二次更新，并更新卡尔曼增益矩阵；进一步更新第k时间步的状态量；直到循环结束获得待识别参数。