本发明涉及一种基于蛋白的药物重定位方法及应用，包括以下步骤：①准备受体蛋白beta‑catenin；②准备配体分子库：选择FDA批准药物小分子化合物作为配体小分子文库；③设置对接活性口袋：以共结晶复合物中配体的位置确定对接中心坐标；④化合物虚拟筛选：在虚拟筛选软件中将配体化合物对接至受体蛋白活性口袋中，并对对接结合能评分进行排序；⑤分子对接：进行分子对接，得到对接效果最佳的构象。本发明提供的药物重定位方法具有快速、高效、低成本等优点，通过虚拟筛选的方法实现了药物重定位，可缩药物短研发周期，降低经济成本，有效提升社会效益。