本发明提出了一种基于FPGA的多色柔版辊印刷机的自动调压系统，用于解决现有多色柔版辊印刷机中存在的调压效率低的技术问题，包括人机界面、控制器和多个多色调压机构，控制器包括均以FPGA作为处理器的主控制器和多个从控制器；多色调压机构包含多个单色调压机构，每个单色调压机构包括四个伺服电机驱动器、四个伺服电机、版辊、墨辊和压印辊；主控制器与多个从控制器直接相连，并根据人机界面指令并行控制多个从控制器，各从控制器控制对应的多色调压机构的不同的伺服电机驱动器，伺服电机驱动器控制伺服电机驱动版辊和墨辊移动，实现对着墨压力和印刷压力的调节。本发明可用于多色柔版辊印刷机领域。