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土壤细菌高通量绝对定量方法

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成果名称: 土壤细菌高通量绝对定量方法 关键字: htaq , 细菌 , 内标 , gfp , 菌株 , 土壤 , 绝对 , 丰度 , 通量 , 计数法 应用行业: 农、林、牧、渔业
高新技术领域: 农业技术 所在地: 浙江省 知识产权类型: 发明专利
知识产权编号: CN201710296291.7 成果体现形式: 成果属性:
成果所处阶段: 授权 成果水平: 国内领先 研究形式:
学科分类: 战略新兴产业: 生物 课题来源:
第一完成单位名称: 浙江大学 第一完成单位属性: 技术成熟度:
合作方式: 技术转让 交易价格(万): 5.00 所属十强产业:

本发明公开了一种土壤细菌高通量绝对定量方法,包括以下步骤:1)、将E.coli HTAQ‑GFP菌体,涡旋重悬于无菌水中,调节菌悬液在紫外分光光度计OD600nm=1.0;2)、对内标菌株HTAQ‑GFP进行绝对定量,获得菌液中内标菌株E.coli HTAQ‑GFP绝对含量;3)、添加内标菌株HTAQ‑GFP菌液至土样并搅拌混匀;4)、提取土壤DNA,进行16S rRNA基因扩增子高通量测序,获得细菌群落结构分类组成信息及对应相对丰度;5)、根据内标菌株HTAQ‑GFP绝对含量及高通量测序结果中Escherichia相对丰度计算获得土壤土著细菌总量及各分类单元的绝对含量。

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