本发明属于污染物处理技术领域。本发明公开了一种用于降解海水中PAHs的固定化藻菌小球材料的制备方法，其包括藻类培养、活性污泥中细菌培养、固定化、多孔材料制备和后处理等步骤，本发明采用包埋固定化技术，将可异养微藻和细菌固定成小球用于降解海水中多环芳烃，利用提高微藻和细菌对PAHs的耐受性，同时藻菌互利共生使得降解PAHs的效率增加，多个小球装入多孔材料中有利于投入海洋中使用，也有利于海洋中PAHs污染问题的解决，其PAHs的降解率可达82-93%。