一种利用相位结构函数增量比选取最优谐波次数的方法，用于提高最优谐波次数选取的准确度，其技术方案是，所述方法首先选取大气湍流相位功率谱密度模型，得到相应的相位结构函数理论值；然后选取参考点位置并给出满足相位屏准确性要求的相位结构函数增量比的取值范围；最后将该相位结构函数增量比的取值范围作为选取最优谐波次数的结束条件，通过计算不同谐波次数时的相位结构函数增量比得到所需的最优谐波次数。本发明根据满足相位屏准确性要求的相位结构函数增量比的取值范围确定最优谐波次数选取的结束条件，不仅能够准确地选出所需的最优谐波次数，降低计算复杂度，而且应用范围广，对三种常用的相位功率谱密度模型均适用。