本发明公开了一种肉质黑孢孔菌纯培养菌丝体及其在人工驯化栽培中的应用。该肉质黑孢孔菌纯培养菌丝体在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏，编号为：CGMCC No.18584。本发明涉及的肉质黑孢孔菌纯培养菌丝体可采用玉米粉培养基平板继代扩繁，可采用小米粒培养基制作栽培菌种，可采用玉米芯培养料及熟料袋栽模式获得子实体。本发明提供了一种野生食药用菌的纯培养菌丝体及人工栽培方法，且该菌丝体为高温型，适合夏秋高温季节人工栽培，不仅为食用菌产业提供了新品种，而且对保护野生蕈菌的多样性也具有重要意义。