本发明公开了一种碳点载药体系的制备方法。以牡丹花粉为原料，尿素为修饰试剂，采用水热法制备出粒径均匀的碳点，再将碳点分别与盐酸阿霉素(DOX)、柠檬酸铁(FAC)进行避光偶联反应，得到CDs‑DOX和CDs‑FAC。本发明所制备的CDs‑DOX载药量高，具有缓释性，且具有癌细胞靶向释放的特征；所制备的CDs‑FAC载药量高，具有缓释性，且胃液释放慢于肠液释放，CDs‑FAC可减轻FAC对胃的刺激作用，有利于小肠吸收，适合口服用药。制备方法简单、操作简便，反应易控制；所得产物有利于改善单纯DOX或FAC的给药效果，减轻其毒副作用，可用于治疗铁紊乱相关疾病。