本发明属于医疗器械生产设备领域，尤其涉及一种医用棉签生产设备，包括箱体，箱体的内部中间一侧设有排列部件；排列部件包括第一转动柱，第一转动柱在箱体的内部转动连接，第一转动柱的外圆周面上套设有第一套筒，箱体的上端一侧固设有漏斗，箱体的内部在漏斗的下方设有排列腔，排列腔为六边形的结构，排列腔的一侧在第一套筒的倾斜上端转动设有第二转动柱，第一套筒与第二转动柱转动接触，第一转动柱与第二转动柱通过电机带动转动，第一套筒的外圆周面上有若干个方便棉签杆的卡槽。本发明使棉签杆依次进行传送的同时对棉签杆进行打磨去除毛刺，进行对棉签杆挤压喷射消毒和进行转动擦拭消毒，使棉签杆消毒充分。