本发明公开了一种富含支链氨基酸的牡蛎DPP‑Ⅳ抑制肽及其制备方法和应用，属于食品营养保健和生物医药技术领域。本发明采用醇沉脱糖和活性炭吸附得到富含支链氨基酸的牡蛎DPP‑Ⅳ抑制肽，体外实验表明：经过胃肠消化后，牡蛎肽对DPP‑Ⅳ的抑制活性较稳定，说明该牡蛎DPP‑Ⅳ抑制肽具有良好的消化稳定性；且肽谱序列特征表明牡蛎肽的支链氨基酸序列特征与其降糖活性和消化稳定性具有密切关系。动物实验结果表明该牡蛎DPP‑Ⅳ抑制肽具有良好的降血糖作用，且效果优于单独的支链氨基酸。本发明为降血糖以及Ⅱ型糖尿病的治疗和预防提供了新方向。