本发明涉及医疗器械技术领域，提供了一种用于导管的抗菌装置、抗菌导管。该装置包括上壳体、下壳体、控制器、振动元件、第一减振垫和压力传感器；上壳体活动盖设于下壳体的开口，上壳体的前后两侧的边缘设有相对设置的第一缺口，下壳体的前后两侧的边缘设有与第一缺口对应的第二缺口；振动元件依次通过第一减振垫和压力传感器与下壳体的内壁连接；控制器分别与压力传感器和振动元件电连接、用于根据压力传感器检测的压力值调节振动元件的振幅。该抗菌导管包括导管以及上述用于导管的抗菌装置。本发明不仅可以保证针对不同导管时均能产生相同的抗菌效果，而且还可以利用第一减振垫阻碍振动能量向下壳体传递、显著减小振动衰减。