本发明公开了基于磁性分子印迹的超声辅助选择性光催化方法及其装置，包括利用磁性分子印迹材料对目标有机污染物进行吸附，通过光催化剂对磁性分子印迹材料所解吸附的目标有机污染物进行光催化降解。本发明借助磁性分子印迹材料的高效选择性吸附能力和磁性分离特性，在磁场的帮助下实现目标有机污染物的富集和转移；在材料设计层面避免了光催化剂与分子印迹层的固载，光催化剂可在超声辅助的条件下，在水中直接地对磁性分子印迹材料所解吸的目标有机污染物进行高效的光催化降解，从而实现对目标有机污染物的高效选择性光催化降解。