本发明公开了一种BVDV表位基因疫苗的构建方法及其应用。它是从NCBI上获得BVDV‑1四种具有免疫原性的C、E0、E2、NS3基因序列，利用生物学方法预测细胞表位；连接获得新肽段（命名为AKK），通过生物学软件分析AKK序列的二级结构、亲水性、抗原性、三级结构；PCR扩增基因序列，构建重组表达载体，经PCR、双酶切和测序等方法检测目的基因。并将构建成功的重组质粒转染至MDBK细胞，通过蛋白免疫印迹和RT‑PCR检测目的基因在细胞水平的表达；通过流式细胞术与ELISA检测IgG抗体水平评价重组质粒免疫效果。