本发明提出一种基于多区域互联的新能源消纳优化系统，属于新能源技术领域。系统包括目标区域确定子系统、区域分离子系统、分散区域优化子系统、能源调度子系统以及调配反馈子系统。目标区域确定子系统确定目标区域后，区域分离子系统将目标区域执行区域分离后，得到多个分散区域；能源调度子系统将接入目标区域的新能源依据每个分散区域的优化目标，在多个分散区域之间调配；调配反馈子系统基于分散区域优化子系统反馈的每个分散区域的优化目标的完成度，生成反馈信号发送至所述能源调度子系统。本发明的技术方案能够基于区域分解实现多区域互联的新能源消纳优化。