本发明涉及一种高分子抗菌微球的制备方法，该方法包括以下步骤：⑴称量总单体、稀土金属希夫碱配合物；总单体由季铵盐型单体、丙烯酸酯类单体、甲基丙烯酸甲酯组成；⑵将甲基丙烯酸甲酯、季铵盐型单体、丙烯酸酯类单体混合均匀后加油溶性引发剂，经超声混合均匀，得到混合液A；⑶在匀速搅拌下，将混合液A缓慢滴加至乙醇水溶液中反应，即得共聚物溶液；⑷在共聚物溶液中依次加入分散剂水溶液、苯乙烯类单体、稀土金属希夫碱配合物、油溶性引发剂，经超声混合均匀，得到混合液B；⑸在匀速搅拌下，将混合液B缓慢滴加至去离子水中反应，得到高分子抗菌微球乳液；⑹经离心分离、洗涤、干燥即得。本发明简单、高效、安全，所得抗菌微球绿色环保。