本实用新型公开了一种智能微波等离子体舰船固废处理系统，包括底座,所述底座上设有处理结构；所述处理结构包括：处理箱体、电机、第一齿轮、两个粉碎辊、两个第二齿轮、分离组件、燃烧室、微波等离子体发生模块、控制器以及储存箱体；本实用新型涉及固废处理技术领域,本案采用的处理结构，通过内置的两个粉碎辊对垃圾进行粉碎处理，再根据垃圾的处理方式操作分离组件工作，通过分离组件将粉碎完成的垃圾导流至储存箱体内或者燃烧室内，对垃圾进行储存或者焚烧处理，有效的解决了现有的固废处理装置功能单一，不能满足对金属、玻璃、纸、纺织品、木材等垃圾进行处理的技术问题。