本发明公开了一种面向安全通信需求的卫星重叠通信方法，用来解决便携式卫星通信终端的安全通信问题，首先发送终端和接收信关站预置掩盖信息序列，经过WFRFT变换和成型滤波，形成掩盖信号基带波形；然后发送终端使用MPSK方式调制有用信息生成通信信号，并与掩盖信号叠加、上变频至卫星轨道后发送至信关站；接收信关站使用预置信号副本复现掩盖信号波形，利用复现波形进行自干扰抵消得到通信信号；本方法利用掩盖信号来降低通信信号的信干噪比，并引入WFRFT变换提高非合作方消除掩盖信号干扰的难度，相较于采用常规调制的卫星重叠通信方法，进一步提高了信号传输的安全性。