本发明公开了一种医疗棉签收纳盒，具体涉及医疗辅助工具领域，包括木棍收纳装置、棉球收纳装置、支撑架和底座，所述木棍收纳装置包括外框和收纳内框，所述外框位于底座上方，所述收纳内框位于外框内侧。本发明通过设置木棍收纳装置、棉球收纳装置和喷液机构，可以使得木棍与棉球分开存放，避免大部分的棉签暴露在外界，降低对棉签污染的概率，保证棉签使用过程中的安全性和无菌性，同时可以实现木棍与棉球之间的快速装配，极大的方便医务人员拿取棉签，方便医疗人员的消毒工作，并且还可以实现在组装棉签的同时对棉签的头部进行喷射消毒液，无需人工蘸取消毒液，极大的方便了医务人员的消毒工作，干净卫生、使用灵活方便。