本实用新型公开了一种微波等离子体危险废物处理系统，包括底座,所述底座上设有处理结构；所述处理结构包括：处理箱体、进料控制组件、两个第一电机、两个搅拌棒、三个微波等离子体发生模块、第二电机、螺旋扇叶以及输送冷却组件；本实用新型涉及危险废物处理技术领域,本案采用的处理结构，通过内置的进料控制组件控制固体危险废物的进料，再通过内置的第一电机带动搅拌棒转动，对固体危险废物进行搅动，与微波等离子体发生模块配合对固体危险废物进行焚烧，经过焚烧的固体危险废物通过螺栓扇叶输送至输送冷却组件内，通过输送冷却组件对焚烧完成的残渣进行冷却降温。