本发明涉及一种补偿声反射的生物内窥式光声图像重建的方法及系统。该方法包括：采用数值仿真的方法获取模拟组织中的成像平面产生的平面超声波；利用超声探测器获取成像导管中的成像平面内的原始光信号；利用所述平面超声波和所述原始光信号确定理想光声信号；根据所述理想光声信号确定所述成像平面上抑制反射伪影后的初始声压分布图像。本发明减少了图像中的反射伪影，提高了图像质量。