本发明涉及水环境治理技术领域，且公开了一种苏云金芽孢杆菌及其应用，该苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis)LUY3，保藏于中国典型培养物保藏中心(武汉)，保藏编号为：CCTCC M 20231033，该一种苏云金芽孢杆菌制备包括以下步骤：样品采集、准备培养基、菌株分离、菌种鉴定，该一种苏云金芽孢杆菌及其应用，从水体等样品中分离出氨氮去除菌，所述的一种苏云金芽孢杆菌应用于养殖废水、城市生活污水等高氨氮污水治理，该菌投入到污水中后，可以利用污水的中的氨氮、含氮物质以及其他有机物作为营养源实现菌体的不断生长繁殖，同时促进水体生态系统中微生物菌群的形成，进而对水体中的含氮有机物分解，降低水体的氨氮含量，达到净化水质的效果。