本发明涉及一种含苯并烯氟菌唑的复配增效杀菌组合物及其应用，该农药组合物活性成分包括苯并烯氟菌唑和活性成分B；其中活性成分B包括甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂、甾醇合成抑制剂、生物源杀菌剂中的一种。本发明农药组合物应用于果蔬主要病害的防治，其速效性和持效性好，作用机制新颖和位点多，能有效延缓病原菌抗药性的发生和发展，对病害不但具有保护作用而且具有良好的治疗作用。该复配增效组合与单剂相比，用药量显著减少，有效降低了药剂对果品及环境的污染。