本实用新型属于接种注射技术领域，具体提供一种玉米茎秆菌液接种注射器，包括注射器本体；注射器针头，注射器针头与注射器本体可拆卸连接，注射器针头的中间开设有若干孔洞，注射器针头的末端密封；对准机构，对准机构包括与注射器本体转动连接的安装箱，安装箱上设置有动力组件，动力组件传动连接有对称设置的主动轮，两主动轮分别与安装箱的侧壁转动连接，两主动轮分别通过传送带传动连接有从动轮，两从动轮与安装箱的侧壁转动连接，两传动带上分别转动连接有夹板，夹板与玉米茎秆接触，两主动轮中间与孔洞对应。本实用新型可以对玉米茎秆的中心进行菌液注射，提高实验结果的精准性。