本发明公开了一种微波辐射式煤炭低温热解脱汞系统，所述脱汞系统在换热器的上方和下方分别设置有第一保护气进口和保护气出口，在微波辐射器的下方和上方分别设置有第二保护气进口和混合气出口；储气罐和气体分离净化器管道连接第一保护气进口，经气体分离净化器净化后的保护气与储气罐内保护气混合后通过第一保护气进口进入换热器，保护气出口管道连接第二保护气进口，保护气从保护气出口排出通过第二保护气进口进入微波辐射器，微波辐射器连接进料控制器，混合气出口管道连接气体分离净化器，气体分离净化器管道连接回收罐；本发明公开的微波辐射式煤炭低温热解脱汞系统汞析出率大、气体处理量小、汞浓度相对高、处理成本低、升温快和受热均匀。