本发明公开了一种芦苇虉草群落中两物种互补利用土壤养分的确定方法，属于植物垂直分布中土壤养分资源高效利用领域。包括如下步骤：分别选择单生虉草种群和单生芦苇种群，动态测量两物种种群下不同层次土壤有效氮（铵态氮和硝态氮）和有效磷含量一年中的动态变化，并结合两物种的生长动态差异和根系分布差异，估算出芦苇种群和虉草种群对土壤有效氮和有效磷的补偿利用率，即两物种对土壤养分资源的互补利用情况。本发明简便易行，数据准确、稳定，可应用于具有垂直分布特征群落土壤中植物的养分互补利用的确定。