本发明公开了一种基于智能生物特征采集处理终端的身份识别系统，包括：智能生物特征采集处理终端、身份认证服务模块，管理服务模块、日志服务模块和网关服务模块。基于上述系统的身份识别方法包括：智能生物特征采集处理终端采集被验证者生物特征信息并进行预处理，再通过网络提交到身份认证服务模块，由身份认证模块与预存相应信息进行比对，并判断接收到的信息是否合法。本发明充分发挥了智能终端资源的作用，减少了网络流量，降低了通讯压力，解决了现有集中式和分布式身份认证的存储和速度瓶颈问题，同时减少了敏感信息泄露的可能性，提高了安全性。