本发明公开一种ETC和MTC智能混合通行系统及方法，该系统中识别系统用于识别驶入车辆的信息；控制系统用于根据所述车辆的信息为该驶入车辆生成通行数组及通行数组队列，进行通行模式判别并控制交易系统进行操作；交易系统用于对驶入ETC车辆和/或MTC车辆进行收费并放行。本发明中ETC和MTC智能混合通行系统及方法，基于车辆精准识别的信号分析，通过引入通行数组和通行数组队列，实现根据数组中关键信息对车辆交易状态和过程进行控制，以及智能队列中车辆信息的循环处理，对车辆进行稳定、准确和实时的识别，做出通行模式的快速准确选择，完成ETC和MTC车辆的智能混合通行。