本发明公开了一种逆变器并联系统的开关次谐波抑制方法和逆变器并联系统，所述方法为：逆变器并联系统中的所有逆变器共用交流母线电压，其中一台逆变器接入并联系统中，其他台逆变器未接入并联系统；接入并联系统的逆变器运行稳定后，每路并联电路均检测到交流母线电压，并根据所述交流母线电压得到每台逆变器的载波同步信号；将每台逆变器均接入并联系统，采用矩形脉冲上升沿和下降沿触发方式，通过捕获中断，得到每台逆变器的载波相位值以及载波的计数方向；将所得到的每台逆变器的载波相位值以及载波的计数方向与零或者载波周期值进行比较，得到每台逆变器的载波周期的调节量，进而调节载波的周期值，实现多台逆变器载波信号的同步。