本发明提供了一种可实现基阶与二阶谐波锁模可切换的光纤激光系统，采用基于反射式石墨烯饱和吸收镜的全保偏光纤锁模技术，采用全保偏光纤谐振腔；全保偏光纤谐振腔可避免环境中外力(压力、弯曲等)引起的光纤双折射变化造成锁模激光不稳定；可保持激光以单一线偏振方向沿保偏光纤慢轴在腔内传输，更易实现锁模脉冲自启动；可减少偏振控制器等元件的使用，降低腔内损耗等优势。所述反射式石墨烯可饱和吸收镜，采用5层以上石墨烯作为可饱和吸收体，石墨烯的调制深度随层数增加而增加，在泵浦功率79mW到102mW获得了基阶锁模脉冲，在到达108mW时获得了二阶锁模脉冲。