本发明提供了一种通过石墨烯反射镜切换波长的锁模光纤激光器系统，所述系统包括依次连接的泵浦源、波分复用光纤耦合器、掺铒增益光纤、隔离器、环形器、金属反射镜、石墨烯可饱和吸收体和输出耦合器，其中所述石墨烯可饱和吸收体贴附于所述金属反射镜表面；所述金属反射镜设置成沿垂直于激光入射的方向旋转一定角度；从所述泵浦源发出的泵浦光通过波分复用光纤耦合器的泵浦端进入所述掺铒保偏增益光纤中，产生的光经过所述环形器逆时针振荡放大，所述环形器把信号光由其第一端口导入到第二端口输出，从第二端口输出的近似准直的激光经过连接的短棒型光纤，经金属反射镜反射，再次入射进第二端口，然后从第三端口出射进入所述输出耦合器。