本发明公开了数据压缩编码的流水线并行加速方法及其系统架构，所述方法把数据压缩编码过程划分为7个可自由选择的环节；除了数据输入输出环节之外，中间的5个环节分别对应5个流水线部件；前后两个部件之间加入不同的数据缓冲区，形成1条编码流水线；每个数据缓冲区存放特定格式的中间数据，使编码流水线中的各部件能够并行处理，类似于CPU的并行流水线，从而提高编码的速度。本发明同时公开了数据压缩编码流水线的系统架构。本发明的方法、流水线系统及专用编码格式，能够在不影响压缩率的前提下，使数据压缩编码的速度比传统的单任务编码速度成倍数地提高。