本发明公开了一种生物质燃料的碱金属元素含量在线动态预测方法及系统。所述方法对所述原始火焰辐射信号进行数据预处理，生成预处理后的火焰全光谱信号和碱金属元素光谱信号；从而根据火焰全光谱信号确定火焰燃烧特征参数和火焰温度，根据碱金属元素光谱信号提取碱金属元素的光谱特征值，共同组成特征参数矩阵，对建立的循环神经网络模型进行训练，生成训练好的生物质燃料碱金属元素含量在线预测模型。采用所述生物质燃料碱金属元素含量在线预测模型即可在线动态预测生物质锅炉中燃烧的生物质燃料的实时碱金属元素含量，提高了生物质燃料碱金属元素含量预测的实时性和准确性。