本发明涉及抗菌材料及纤维改性技术领域；本发明提供了一种汉麻抗菌纤维材料及其应用，其中，汉麻纤维大分子链上接枝有季铵抗菌功能基团，所述季铵抗菌功能基团为共价连接有羟基丙基三甲基卤化铵基的三乙烯四胺基团。本发明将季铵抗菌功能基团共价接枝在汉麻纤维骨架结构中，使汉麻抗菌纤维含季铵抗菌功能基团，具有优良的抗菌性能，对人体无毒害，抗菌持久，性能稳定。进一步地，所述汉麻抗菌纤维材料的制备方法工艺简单、操作简便，易于控制，且对环境友好。同时，反应得到的纤维没有刺鼻的胺味等，仍具有良好的形态和机械强度，能应用于各种抗菌功能纺织品的开发及工业、民用水的杀菌消毒。