本发明公开了燃料电池低温冷却系统设计方法、装置、介质及设备，该方法包括：获取冷却系统中的每个零部件的流量需求及对应的压降；设计初始冷却水路及选定水泵的参数和散热器的型号；对初始冷却水路进行流量和压降仿真，获得每个零部件的仿真流量；若其中一个零部件的仿真流量小于零部件对应的预设流量，则调整初始冷却水路；获得与初始冷却水路的总仿真流量对应的散热功率，若散热功率大于散热器的额定散热量，则重新选择散热器的型号；获得逆变器和DC/DC电源模块的出口水温，根据逆变器的出口水温和DC/DC电源模块的进口水温，调整初始冷却水路。本发明在满足零部件散热需求的同时，使水泵和散热器性能达到最合理的使用和配置。