本发明提供一种藻类生长抑制剂组合物及其制备方法，其可以有效抑制富营养化受污染水域的藻类生长，并且对环境友好，不会对环境或人体产生任何危害；其包含改性黏土80‑100份、聚丙烯酰胺絮凝剂10‑20份、马尾藻粉10‑20份、海带粉10‑20份、活性炭50‑80份。