本发明请求保护一种基于特征分解和梅西算法的DSSS/UQPSK信号的伪码序列估计方法，属于通信技术领域。本方法首先按照长码周期进行分段，再在每段里面再按照信息码元宽度进行分段，然后按照特征分解的方法得到短码序列和各段的长PN码序列，对得到的各段长PN码序列选取其中一部分求取生成多项式，最后根据生成多项式恢复出整周期的长PN码序列。使用本方法除了提高PN码估计的效率外，更主要的是提高了PN码估计的准确性，且能有效的解决长码序列恢复所存在的相位模糊问题。本方法对PN码本身的特性没有任何的先验知识要求，只需知道长、短PN码的周期即可。所以在无线电管理、军事通信侦察、截获、相关干扰等诸多领域具有应用前景。