本发明涉及一种防伪打标系统，包括打标系统、采样系统和控制设备；所述打标系统包括防伪打标装置和常规打标装置；所述采样系统包括采样设备和信息存储设备；所述采样设备与信息存储设备连接；所述打标系统和采样系统均与控制设备连接；所述控制设备包括主控制器、传感器和执行控制器，控制设备用以控制打标系统和采样系统的协调工作，并将采集的数据实时或批量传输给远端服务器。本系统从技术上保证了制作出的标记具有唯一性、无法复制性，而且将采集到的标记信息实时或事后传输到远端服务器，在鉴定标记时做为标准样品使用，工作效率高，适用于工业流水线上连续生产的需要。