一种基于足点域杂交的DNA测定新方法，属于化学发光技术领域。将目标DNA加入DNA1修饰磁珠中，目标DNA的一端与DNA1的一端单链部分杂交形成足点域，在足点域作用下目标DNA未杂交的部分与DNA1继续进行杂交反应，将DNA1的发卡结构打开，同时形成双链DNA，再加入FITC标记DNA2探针，DNA2的一端与所形成的双链DNA的一端单链部分杂交形成足点域，在足点域的作用下DNA2未杂交的部分与双链DNA继续进行杂交反应，形成新的双链DNA，将目标DNA替换下来进行循环利用，并将大量的DNA2附着在磁珠上，利用光二极管诱导化学发光原理实现对目标DNA的测定。本发明方法简单、成本低、灵敏度高。