本发明属于真菌毒素提取技术领域，特别涉及一种适用于液质联用检测的中药中真菌毒素提取方法，干燥粉碎，水超声提取后加入体积浓度为1.5％-3％甲酸的乙腈混合液和盐析剂，混匀后超声提取，然后800r/min条件下离心过滤；再加入浓缩剂振摇后2000-2500r/min条件下离心3-8min；加入氧化铝离心后氮气吹干，再乙腈水溶液溶解，过0.25μm滤膜。本发明对粉碎后的中药材经两次超声提取，依次经粗提、浓缩富集、除杂纯化步骤使提取的中药中的真菌毒素溶液纯度高，液质联用检测结果质量高。