本申请实施例公开了一种应用于车载空调的杀菌装置及车载空调系统，所述装置包括：用于与车载空调的滤芯连接的杀菌模块，所述杀菌模块用于对所述滤芯流出的空气进行紫外杀菌，其中，所述杀菌模块与所述滤芯插接连接；所述杀菌模块包括：电驱动板，所述电驱动板围合形成所述杀菌模块的空气流通区域；灯管，所述灯管安装在所述电驱动板朝向所述空气流通区域的一侧上，以通过所述电驱动板为所述灯管供电。本申请旨在解决车内的空调使用过程中无法对细菌、真菌等微生物进行灭杀的问题，加强用户在用车过程中的健康保障。