本发明提供了一种可变气门升程机构升程切换执行器控制方法与控制系统，本发明的控制方法包括在气门升程切换初始控制器输出预设占空比的初始驱动信号，以由其获得执行器绕组线圈当前的阻值，并在后续升程切换过程中基于已获得的绕组线圈阻值，通过执行器升程切换驱动电流阈值和对执行器绕组线圈当前电流的采样，实时获取绕组线圈的阻值，并基于该实时阻值确定控制器应输出的驱动信号的占空比。本发明利用对驱动信号占空比的实时调整，可使得执行器线圈绕组的电流保持在设置的升程切换驱动电流阈值，能够提高执行器的控制精度，保证可变气门升程机构准确实现气门升程切换。