本发明提供了一种可变压缩比发动机控制方法，其用于具有可变压缩比机构的发动机运行的控制，可变压缩比机构具有由电机驱使转动的偏心轴，检测偏心轴转角的传感器，以及设于发动机内的曲轴与活塞及偏心轴三者间的多连杆机构，控制方法包括发动机上电后，进行压缩比位置自学习，且由当前压缩比位置先学习到最小压缩比位置，再学习到最大压缩比位置；若自学习成功，进入最小压缩比位置，并等待发动机启动，若自学习失败，获取当前压缩比位置及该当前压缩比位置对应的压缩比值，由该压缩比值对应的节气门开度启动发动机。本发明的可变压缩比发动机控制方法通过对压缩比位置的自学习，能够避免可变压缩比机构因机构磨损导致的压缩比控制不准确的问题。